Aktuální číslo:

2018/10

Téma měsíce:

Navigace

Ty druhé viry v našem genomu

Historie psaná viry
 |  13. 7. 2017
 |  Vesmír 96, 402, 2017/7
 |  Téma: Virologie

Jaký význam a jakou roli mají sekvence v DNA, které mají původ v cizích druzích organismů? Ukazuje se, že všechny viry jsou pravděpodobně schopné vstoupit do zárodečných linií živočichů.

Začněme trochu z jiné strany. Dramatický nárůst v kapacitě sekvenačních technologií v posledních letech umožnil poznání kompletní sekvence nejen lidského genomu, ale i genomu řady dalších organismů. V současnosti je přečteno přes sto genomů obratlovců, ambiciózní projekty typu Earth BioGenome Project však slibují nasekvenovat doslova vše, co se na zemi hýbe. Technologie masivního sekvenování ale nutně vnáší do získaných dat informační šum, tedy sekvence, které do genomu daného druhu nepatří a dostaly se tam například během přípravy vzorku jako kontaminace.

Dvě nedávné studie kupříkladu ukázaly, že testovaná data jsou přibližně v 80 % kontaminovaná cizodruhovými sekvencemi a 20 % dokončených genomových sekvencí neprimátích druhů obsahuje lidskou DNA. Těchto faktů si byli výzkumníci v oboru genomiky vědomi. Zřejmě proto se dlouho nikdo nezabýval tím, zda některé z těchto sekvencí, ukazující například na bakteriální či virový původ, nejsou v genomu vyšších živočichů opravdu přítomny.

Až v roce 2010 Keizo Tomonaga z Kjótské univerzity překvapil vědeckou obec zjištěním, že lidský genom opravdu obsahuje napohled cizí sekvence velmi podobné bornavirům. Ty způsobují neurologické infekce domácích zvířat, jejich patogenicita pro člověka je však nejasná. Jméno dostaly podle rozsáhlé epidemie koní v saském městě Borna v roce 1885. Tomonaga experimentálně prokázal přítomnost částí bornavirů v lidském genomu a nazval je EBLN elementy (podle anglického názvu endogenous Borna-like N elements).

Nyní vidíte 22 % článku. Co dál:

Jsem předplatitel, mám plný přístup
Jsem návštěvník
Chci si přečíst celé číslo
Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru. Více o předplatném
TÉMA MĚSÍCE: Virologie
OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Virologie

O autorech

Jan Pačes

Daniel Elleder

Další články k tématu

Jan Svoboda

Letos se bohužel uzavřely život a dílo Jana Svobody. Chtěli bychom připomenout význam jeho práce sérií článků, které vysvětlují myšlenkové zákruty...

Ptačí sarkomové a leukózové viryuzamčeno

Historie ptačích sarkomových a leukózových virů (ASLV, avian sarcoma and leukosis virus) začala zdánlivě náhodou: Francis Peyton Rous (1879–1970),...

Integrujte se a množte seuzamčeno

Za objev integrovaných provirů byla roku 1975 udělena Nobelova cena. K tomuto objevu významnou měrou přispěl svými experimenty také prof. Jan...

Skládanka HIVuzamčeno

Účinná antiretrovirová terapie uklidnila část veřejnosti s nízkým vnímáním rizika a počet nakažených virem HIV začal v posledních letech opět...

Latence HIV a perspektivy vyléčeníuzamčeno

Velmi rafinovaná strategie HIV vzdoruje jednoduchým léčebným zásahům. Zásadní překážkou vyléčení je zabudování genetické informace HIV do genomu...

Slepice jako laboratorní zvíře

Historie Ústavu molekulární genetiky je spjata se dvěmi význačnými osobnostmi naší vědy, Milanem Haškem a Janem Svobodou. Oba také stáli blízko...

Doporučujeme

Vlaštovka extrémista

Vlaštovka extrémista

Jaroslav Cepák, Petr Klvaňa  |  10. 10. 2018
Díky satelitní telemetrii se podařilo odhalit vpravdě neuvěřitelné výkony některých ptačích druhů. Nejznámějším je zřejmě osmidenní nonstop let...
Velké umění astronavigace: Od astrolábu po sextant

Velké umění astronavigace: Od astrolábu po sextant

Petr Scheirich  |  1. 10. 2018
Staří mořeplavci prý určovali polohu své lodi podle hvězd. Tato rozšířená romantická představa je ale nesprávná. Metoda astronavigace nikdy nebyla...
Jak se neztratit na moři

Jak se neztratit na moři

Petr Scheirich  |  1. 10. 2018
Dle znamenitého pozorování Slunce a Měsíce shledávám naši zeměpisnou délku 178° 18' 30" západně od Greenwiche. Zeměpisná délka dle logu je 175°...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné