Aktuální číslo:

2025/7

Téma měsíce:

Umění

Obálka čísla

Databáze starodávné mtDNA

 |  6. 5. 2019
 |  Vesmír 98, 267, 2019/5

V po sledních letech rychle přibývá počet přečtených mitochondriálních genomů z archeologických nálezů. Mitochondriální DNA (mtDNA) se dědí pouze po matce a díky relativně malé velikosti a velkém počtu kopií v každé buňce je šance na její získání ze starých kostí vyšší než u jaderného genomu. Geografická variabilita mitochondriálních linií je dobře popsána. Z těchto důvodů se jedná o užitečný nástroj populační genetiky, který umožňuje studovat vývoj a šíření dávných lidských populací.

Vědci z oddělení genomiky a bioinformatiky Ústavu molekulární genetiky AV ČR nedávno spustili AmtDB – první databázi starých lidských mitochondriálních genomů. Je volně přístupná na adrese http://amtdb.org. V okamžiku spuštění obsahovala 1107 vzorků, bude se však postupně rozšiřovat. Ke stažení jsou kompletní sekvence mtDNA opatřené informacemi o stáří, lokalitě, zařazení k odpovídající kultuře, odkazy na související publikace atd. Nejmladší vzorky pocházejí z prvního tisíciletí našeho letopočtu, nejstarší z doby před 40 000 lety, většina však spadá do neolitu a doby bronzové. Převládá Evropa, nechybí však ani vzorky z Blízkého východu a střední Asie (včetně známé „ženy X“ patřící k denisovanům). Součástí databáze je i interaktivní mapa lokalit, z nichž vzorky pocházejí.

Ehler E. et al., Nucleic Acids Res., DOI: 10.1093/nar/gky843

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie, Genetika
RUBRIKA: Zákulisí

O autorovi

Ondřej Vrtiška

Původním vzděláním biolog se specializací na hydrobiologii (PřF UK), utekl z oborů žurnalistika a kulturní antropologie (obojí FSV UK). Od r. 2001 pracoval jako vědecký novinář (ABC, Český rozhlas, TÝDEN, iHNed.cz), na téma „věda v médiích“ přednáší pro vědce i pro laickou veřejnost. Věnuje se popularizaci vědy, spolupracuje s Učenou společností České republiky. Z úžasu nevycházející pozorovatel memetické vichřice. Občas napíná plachty, občas staví větrolam.
Vrtiška Ondřej

Doporučujeme

Najít své těžiště kontroly

Najít své těžiště kontroly uzamčeno

„Svobodu, nebo smrt je návod, jak vyhrát bitvu, ale zároveň recept na rozchod,“ říká bývalý hlavní armádní psychiatr Jan Vevera. Faktory, které...
Věstonická superstar

Věstonická superstar video

Soška tělnaté ženy z ústředního tábořiště lovců mamutů u dnešních Dolních Věstonic pod Pálavou je jistě nejznámějším archeologickým nálezem...
K čemu je umění?

K čemu je umění? uzamčeno

Petr Tureček  |  7. 7. 2025
Výstižná teorie lidské evoluce by měla nabídnout vysvětlení, proč trávíme tolik času zdánlivě zbytečnými činnostmi. Proč, jako například lvi,...