Siemens2025Siemens2025Siemens2025Siemens2025Siemens2025Siemens2025

Aktuální číslo:

2025/9

Téma měsíce:

Cyklus

Obálka čísla

Arabidopsis má „přečtený“ bibliom

 |  9. 9. 2010
 |  Vesmír 89, 507, 2010/9

Dnešní biolog tráví podstatnou část pracovní doby u počítače, a to nejenom kvůli návykovosti webu a e‑mailu. S dostupností genomických expresních dat se u modelových organismů počítá jako se samozřejmou věcí. Neustále se objevují nové databáze. Martin Krallinger s kolegy připravil nástroj (PLAN2L, Plant Anotation to Literature – viz zope.bioinfo.cnio.es/plan2l/plan2l.html), který usiluje o shrnutí znalostí o jednotlivých genech a jimi kódovaných proteinech huseníčku Thalova (Arabidopsis thaliana), tak jak jsou sepsány ve vědeckých článcích. Vyhledávání tedy nenabídne prostý souhrn článků, ve kterých se zadané klíčové slovo vyskytuje, ale rovnou i automatizovaný výběr vět, které nejvíce vypovídají o proteinových interakcích, lokalizaci, související regulaci genové exprese a mnoha dalších vlastnostech.

Relevanci výsledků nechť posoudí každý sám, mně se nezdá vůbec špatná. Lze jistě očekávat jak zlepšování „pokrytí“ této databáze, tak vznik bibliomů nových. Strohost a rigidnost psané vědecké komunikace se možná stává důležitou výhodou. Sestaví někdo v zájmu ještě snazšího strojového zpracování i seznam povolených slov a obratů?

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie
RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Radek Bezvoda

 

Doporučujeme

Hospodářský cyklus: od Velké krize po současnost

Hospodářský cyklus: od Velké krize po současnost

Pavel Potužák  |  1. 9. 2025
Kolísání produkce, zaměstnanosti a inflace provází tržní ekonomiky minimálně od konce průmyslové revoluce. Proč v některých obdobích hospodářství...
Globální eliminace poliovirů očkováním

Globální eliminace poliovirů očkováním uzamčeno

Vladimír Vondrejs  |  1. 9. 2025
Je to už dávno (1960), co jsme u nás jako první na světě oslavili úplné odstranění poliovirů a rotariáni začali uvažovat o velké investici...
Do nitra Etny

Do nitra Etny

Lukáš Krmíček  |  1. 9. 2025
Etna neohrožuje jen zvědavé turisty či blízká lidská osídlení svými erupcemi. Může být nebezpečná i nestabilitou svých sopečných svahů.