Aktuální číslo:

2019/2

Téma měsíce:

Barvy

Arabidopsis má „přečtený“ bibliom

 |  9. 9. 2010
 |  Vesmír 89, 507, 2010/9

Dnešní biolog tráví podstatnou část pracovní doby u počítače, a to nejenom kvůli návykovosti webu a e‑mailu. S dostupností genomických expresních dat se u modelových organismů počítá jako se samozřejmou věcí. Neustále se objevují nové databáze. Martin Krallinger s kolegy připravil nástroj (PLAN2L, Plant Anotation to Literature – viz zope.bioinfo.cnio.es/plan2l/plan2l.html), který usiluje o shrnutí znalostí o jednotlivých genech a jimi kódovaných proteinech huseníčku Thalova (Arabidopsis thaliana), tak jak jsou sepsány ve vědeckých článcích. Vyhledávání tedy nenabídne prostý souhrn článků, ve kterých se zadané klíčové slovo vyskytuje, ale rovnou i automatizovaný výběr vět, které nejvíce vypovídají o proteinových interakcích, lokalizaci, související regulaci genové exprese a mnoha dalších vlastnostech.

Relevanci výsledků nechť posoudí každý sám, mně se nezdá vůbec špatná. Lze jistě očekávat jak zlepšování „pokrytí“ této databáze, tak vznik bibliomů nových. Strohost a rigidnost psané vědecké komunikace se možná stává důležitou výhodou. Sestaví někdo v zájmu ještě snazšího strojového zpracování i seznam povolených slov a obratů?

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie
RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Radek Bezvoda

 

Doporučujeme

Lov kýchajících demokratů

Lov kýchajících demokratů uzamčeno

Tomáš Grim  |  4. 2. 2019
Spatřit loveckou akci volně žijících predátorů je svátek. A být jejím svědkem od úplného začátku po úplný konec, z bezprostřední blízkosti, s...
(Ne)barevné vidění hlubokomořských ryb

(Ne)barevné vidění hlubokomořských ryb uzamčeno

Zuzana Musilová  |  4. 2. 2019
Je velmi obtížné vžít se do světa hlubokomořské ryby. Žijete ve zdánlivě nekonečném trojrozměrném oceánu, kam neproniká téměř žádné světlo a kde...
Optická pinzeta a světelný záblesk

Optická pinzeta a světelný záblesk

Hana Turčičová  |  4. 2. 2019
Nobelova cena za optickou pinzetu a za triky, jak zvýšit výkon a nezničit aktivní prostředí laseru.

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné