Aktuální číslo:

2025/7

Téma měsíce:

Umění

Obálka čísla

Arabidopsis má „přečtený“ bibliom

 |  9. 9. 2010
 |  Vesmír 89, 507, 2010/9

Dnešní biolog tráví podstatnou část pracovní doby u počítače, a to nejenom kvůli návykovosti webu a e‑mailu. S dostupností genomických expresních dat se u modelových organismů počítá jako se samozřejmou věcí. Neustále se objevují nové databáze. Martin Krallinger s kolegy připravil nástroj (PLAN2L, Plant Anotation to Literature – viz zope.bioinfo.cnio.es/plan2l/plan2l.html), který usiluje o shrnutí znalostí o jednotlivých genech a jimi kódovaných proteinech huseníčku Thalova (Arabidopsis thaliana), tak jak jsou sepsány ve vědeckých článcích. Vyhledávání tedy nenabídne prostý souhrn článků, ve kterých se zadané klíčové slovo vyskytuje, ale rovnou i automatizovaný výběr vět, které nejvíce vypovídají o proteinových interakcích, lokalizaci, související regulaci genové exprese a mnoha dalších vlastnostech.

Relevanci výsledků nechť posoudí každý sám, mně se nezdá vůbec špatná. Lze jistě očekávat jak zlepšování „pokrytí“ této databáze, tak vznik bibliomů nových. Strohost a rigidnost psané vědecké komunikace se možná stává důležitou výhodou. Sestaví někdo v zájmu ještě snazšího strojového zpracování i seznam povolených slov a obratů?

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie
RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Radek Bezvoda

 

Doporučujeme

Věstonická superstar

Věstonická superstar video

Soška tělnaté ženy z ústředního tábořiště lovců mamutů u dnešních Dolních Věstonic pod Pálavou je jistě nejznámějším archeologickým nálezem...
K čemu je umění?

K čemu je umění? uzamčeno

Petr Tureček  |  7. 7. 2025
Výstižná teorie lidské evoluce by měla nabídnout vysvětlení, proč trávíme tolik času zdánlivě zbytečnými činnostmi. Proč, jako například lvi,...
Paradoxní příběh paradoxu obezity

Paradoxní příběh paradoxu obezity uzamčeno

Petr Sucharda  |  7. 7. 2025
Obezita představuje jednu z nejzávažnějších civilizačních chorob, jejíž důsledky zasahují do téměř všech oblastí lidského zdraví. Její definice...