Aktuální číslo:

2021/1

Téma měsíce:

Roboti

Bakteriální transkriptom při infekci rostliny

 |  3. 12. 2018
 |  Vesmír 97, 687, 2018/12

Při výzkumu interakcí rostlin a mikrobů (zde bakterií) je zásadní problém studium bakteriálních pochodů v čase infekce, tedy přímo v rostlině. Kolegům z Německa a USA se to podařilo při sledování bakteriálního transkriptomického profilu. Transkriptom je soubor molekul RNA vzniklých z DNA přepisem (transkripcí). Jde hlavně o mRNA, ale mohou to být i nekódující ribonukleové kyseliny.

Transkriptom získaný z bakterií kultivovaných in vitro (i těch, které byly kultivované v syntetickém médiu stimulujícím virulenci) se liší od transkriptomu v rostlině. Bakteriální transkriptom lze ovlivnit imunitními procesy rostliny. Například různé kmeny bakterie Pseudomonas syringae vyvolávají různě silnou reakci huseníčku rolního. Němečtí biologové sledovali transkriptom u dvaceti sedmi kombinací huseníčku s bakterií šest hodin po infekci. Transkriptomický profil v tomto časném stadiu jasně předpovídá výslednou infekci, která se projeví dva dny po inokulaci bakterií.

Detailní transkriptomická analýza ukázala, že rostlinná imunita výrazně potlačuje bakteriální dráhu reagující na přítomnost železa. Autoři si vytipovali jeden gen (pvdS) silně potlačený imunitou a vyvolali v bakterii jeho nadprodukci. Tím se bakterie stala mnohem infekčnější. A to je pouze jedna z mnoha informací, kterou v sobě získaný transkriptom skrývá. Jeho porovnání se známým rostlinným transkriptomem nám jistě skýtá mnoho dalších odhalení. Díky nim ještě lépe poznáme vztahy mezi rostlinou a bakterií a můžeme je využít k efektivnějšímu vývoji zemědělských plodin se zvýšenou odolností vůči patogenům.

Cohen S. P. et al., Trends in Plant Science, DOI: 10.1016/j.tplants.2018.06.008; Nobori R. et al., PNAS, DOI: 10.1073/pnas.1800529115

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie, Genetika
RUBRIKA: Mozaika

O autorovi

Martin Janda

Ing. Martin Janda, Ph. D., (*1987) vystudoval biochemii na VŠCHT v Praze a pracoval v Ústavu experimentální botaniky AV ČR. V současné době bádá pod hlavičkou VŠCHT a Ludwig-Maxmilians-Universität München (LMU). Ve své práci se zabývá interakcí mezi rostlinami a mikroorganismy.
Janda Martin

Doporučujeme

Jeden trhák, co zaplatí náklady

Jeden trhák, co zaplatí náklady

Eva Bobůrková  |  4. 1. 2021
Po vysoké škole aspirantura, pak vojenská služba, návrat do ústavu na jaře 1987. Ale pak přišla turbulentní devadesátá léta. „V roce 1992 jsem se...
Autonomní zabijáci

Autonomní zabijáci

David Černý  |  4. 1. 2021
O životě a smrti na bitevním poli stále ještě rozhoduje člověk, i když samotné provedení smrtícího útoku se čím dál více svěřuje dronům a moderním...
Kriminalizace amatérské entomologie

Kriminalizace amatérské entomologie

Sběr a výzkum hmyzu má v České republice pevné kořeny a dlouholetou tradici. V současné době však zažívá těžké časy. Kromě odlivu zájmu mladých...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné