Aktuální číslo:

2019/2

Téma měsíce:

Barvy

Bakteriální transkriptom při infekci rostliny

 |  3. 12. 2018
 |  Vesmír 97, 687, 2018/12

Při výzkumu interakcí rostlin a mikrobů (zde bakterií) je zásadní problém studium bakteriálních pochodů v čase infekce, tedy přímo v rostlině. Kolegům z Německa a USA se to podařilo při sledování bakteriálního transkriptomického profilu. Transkriptom je soubor molekul RNA vzniklých z DNA přepisem (transkripcí). Jde hlavně o mRNA, ale mohou to být i nekódující ribonukleové kyseliny.

Transkriptom získaný z bakterií kultivovaných in vitro (i těch, které byly kultivované v syntetickém médiu stimulujícím virulenci) se liší od transkriptomu v rostlině. Bakteriální transkriptom lze ovlivnit imunitními procesy rostliny. Například různé kmeny bakterie Pseudomonas syringae vyvolávají různě silnou reakci huseníčku rolního. Němečtí biologové sledovali transkriptom u dvaceti sedmi kombinací huseníčku s bakterií šest hodin po infekci. Transkriptomický profil v tomto časném stadiu jasně předpovídá výslednou infekci, která se projeví dva dny po inokulaci bakterií.

Detailní transkriptomická analýza ukázala, že rostlinná imunita výrazně potlačuje bakteriální dráhu reagující na přítomnost železa. Autoři si vytipovali jeden gen (pvdS) silně potlačený imunitou a vyvolali v bakterii jeho nadprodukci. Tím se bakterie stala mnohem infekčnější. A to je pouze jedna z mnoha informací, kterou v sobě získaný transkriptom skrývá. Jeho porovnání se známým rostlinným transkriptomem nám jistě skýtá mnoho dalších odhalení. Díky nim ještě lépe poznáme vztahy mezi rostlinou a bakterií a můžeme je využít k efektivnějšímu vývoji zemědělských plodin se zvýšenou odolností vůči patogenům.

Cohen S. P. et al., Trends in Plant Science, DOI: 10.1016/j.tplants.2018.06.008; Nobori R. et al., PNAS, DOI: 10.1073/pnas.1800529115

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie, Genetika
RUBRIKA: Mozaika

O autorovi

Martin Janda

Ing. Martin Janda, Ph. D., (*1987) vystudoval biochemii na VŠCHT v Praze a pracoval v Ústavu experimentální botaniky AV ČR. V současné době bádá pod hlavičkou VŠCHT a Ludwig-Maxmilians-Universität München (LMU). Ve své práci se zabývá interakcí mezi rostlinami a mikroorganismy.
Janda Martin

Doporučujeme

Lov kýchajících demokratů

Lov kýchajících demokratů uzamčeno

Tomáš Grim  |  4. 2. 2019
Spatřit loveckou akci volně žijících predátorů je svátek. A být jejím svědkem od úplného začátku po úplný konec, z bezprostřední blízkosti, s...
(Ne)barevné vidění hlubokomořských ryb

(Ne)barevné vidění hlubokomořských ryb uzamčeno

Zuzana Musilová  |  4. 2. 2019
Je velmi obtížné vžít se do světa hlubokomořské ryby. Žijete ve zdánlivě nekonečném trojrozměrném oceánu, kam neproniká téměř žádné světlo a kde...
Optická pinzeta a světelný záblesk

Optická pinzeta a světelný záblesk

Hana Turčičová  |  4. 2. 2019
Nobelova cena za optickou pinzetu a za triky, jak zvýšit výkon a nezničit aktivní prostředí laseru.

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné