Aktuální číslo:

2017/12

Téma měsíce:

Kontakty

Jak se předpovídá pozice nukleozomů

 |  10. 5. 2007
 |  Vesmír 86, 271, 2007/5

Nukleozomy lze přirovnat k cívečkám, na nichž jsou navinuty krátké úseky DNA (asi po 200 nukleotidech), a řetězec cíveček je pak stočen do šroubovice. Dříve se předpokládalo, že nukleozomy plní jen strukturní funkci – pomáhají sbalit dlouhé vlákno DNA do hutnější podoby, která umožňuje vznik chromozomálního vlákna. Uvažovalo se i o tom, že by nukleozomy mohly plnit regulační funkci, protože svým víceméně pravidelným rozmístěním na vláknu DNA v některých místech brání přístupu regulačních proteinů k vlastnímu řetězci DNA. Nedávné výzkumy však ukázaly, že funkce nukleozomů v regulaci genetických procesů je složitější.

Ilya P. Ioshikhes z Ohijské státní univerzity a jeho kolegové z Pensylvánské státní univerzity loni různými výpočetními metodami srovnávací genomiky předpověděli pozici nukleozomů u některých genů v genomu kvasinky Saccharomyces cerevisiae. Hledali pro předpověď obecný vzorec a brzy zjistili, že je to „trochu složitější“. Pozice nukleozomů se totiž liší u různých genů v závislosti na tom, zda obsahují TATA-box (oblast bohatou na adenin a thymin, kde se při přepisu vlákna DNA rozvolňují).

Geny s TATA-boxem se těmto vědcům podařilo rozdělit ještě do tří skupin podle pozice specifických sekvencí pro nukleozomy, tedy i podle regulace. Zařazení do skupiny souvisí s funkcí genu a její důležitostí pro buňku. Například do téže skupiny, která je na regulaci pomocí nukleozomů úplně nezávislá, patří vesměs „house keeping“ geny. Ty mají velmi důležité funkce v buňce – a špatná regulace může buňku zahubit.Během výzkumu američtí badatelé objevili také některé obecné charakteristiky nukleozomů. Podle jejich soudu lze tytéž metody použít pro ostatní eukaryotické organizmy. (Nature Genetics 10, 1210–1215, 2006)

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie
RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Václav Janoušek

Václav Janoušek (*1986) vystudoval biologii na Přf UK v Praze, kde se v současnosti zabývá populační genomikou a evolucí genomu u různých organismů.

Doporučujeme

Přemýšlej, než začneš kreslit

Přemýšlej, než začneš kreslit

Ondřej Vrtiška  |  4. 12. 2017
Nástup počítačů, geografických informačních systémů a velkých dat proměnil tvorbu map k nepoznání. Přesto stále platí, že bez znalosti základů...
Tajemná „Boží země“ Punt

Tajemná „Boží země“ Punt uzamčeno

Břetislav Vachala  |  4. 12. 2017
Mnoho vzácného zboží starověkého Egypta pocházelo z tajemného Puntu, kam Egypťané pořádali časté obchodní výpravy. Odkud jejich expedice...
Hmyz jako dokonalý létací stroj

Hmyz jako dokonalý létací stroj

Rudolf Dvořák  |  4. 12. 2017
Hmyz patří k nejdokonalejším a nejstarším letcům naší planety. Jeho letové schopnosti se vyvíjely přes 300 milionů let a předčí dovednosti všech...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné