Aktuální číslo:

2018/2

Téma měsíce:

Bionika

Jak se předpovídá pozice nukleozomů

 |  10. 5. 2007
 |  Vesmír 86, 271, 2007/5

Nukleozomy lze přirovnat k cívečkám, na nichž jsou navinuty krátké úseky DNA (asi po 200 nukleotidech), a řetězec cíveček je pak stočen do šroubovice. Dříve se předpokládalo, že nukleozomy plní jen strukturní funkci – pomáhají sbalit dlouhé vlákno DNA do hutnější podoby, která umožňuje vznik chromozomálního vlákna. Uvažovalo se i o tom, že by nukleozomy mohly plnit regulační funkci, protože svým víceméně pravidelným rozmístěním na vláknu DNA v některých místech brání přístupu regulačních proteinů k vlastnímu řetězci DNA. Nedávné výzkumy však ukázaly, že funkce nukleozomů v regulaci genetických procesů je složitější.

Ilya P. Ioshikhes z Ohijské státní univerzity a jeho kolegové z Pensylvánské státní univerzity loni různými výpočetními metodami srovnávací genomiky předpověděli pozici nukleozomů u některých genů v genomu kvasinky Saccharomyces cerevisiae. Hledali pro předpověď obecný vzorec a brzy zjistili, že je to „trochu složitější“. Pozice nukleozomů se totiž liší u různých genů v závislosti na tom, zda obsahují TATA-box (oblast bohatou na adenin a thymin, kde se při přepisu vlákna DNA rozvolňují).

Geny s TATA-boxem se těmto vědcům podařilo rozdělit ještě do tří skupin podle pozice specifických sekvencí pro nukleozomy, tedy i podle regulace. Zařazení do skupiny souvisí s funkcí genu a její důležitostí pro buňku. Například do téže skupiny, která je na regulaci pomocí nukleozomů úplně nezávislá, patří vesměs „house keeping“ geny. Ty mají velmi důležité funkce v buňce – a špatná regulace může buňku zahubit.Během výzkumu američtí badatelé objevili také některé obecné charakteristiky nukleozomů. Podle jejich soudu lze tytéž metody použít pro ostatní eukaryotické organizmy. (Nature Genetics 10, 1210–1215, 2006)

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Molekulární biologie
RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Václav Janoušek

Václav Janoušek (*1986) vystudoval biologii na Přf UK v Praze, kde se v současnosti zabývá populační genomikou a evolucí genomu u různých organismů.

Doporučujeme

Návrat Široka

Návrat Široka

Pavel Pipek  |  9. 2. 2018
Zpráva, která na mě právě vyskočila na Twitteru, by asi většinu Evropanů nechala chladnou, ale mé srdce buší tak, že mám chuť okamžitě vyskočit z...
Rytíř našich vod

Rytíř našich vod

Marek Janáč  |  5. 2. 2018
Na stěně ve své kanceláři má vystavené krunýře velkých raků. Za jeho pracovní židlí v akváriu rak. V knihovně knihy o racích a v laboratoři ve...
O kvantových počítačích a šifře RSA

O kvantových počítačích a šifře RSA uzamčeno

Jiří Poš  |  5. 2. 2018
značným příslibem pro výpočetní systémy budoucnosti je rozvíjející se obor kvantových počítačů. Představují naději, že eliminují některá vážná...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné