Puzzle jaderného póru

Kombinací experimentálních a výpočetních technik se podařilo získat detailní strukturu jednoho z nejsložitějších proteinových komplexů, lidského jaderného póru. Těmito póry z jádra proudí mimo jiné RNA přepisovaná z DNA. Sestávají z tisíce proteinových jednotek třiceti různých druhů. Dosavadní modely dokázaly zpracovat jen 46 % celé struktury, nová verze zvládla 90 %. Umělá inteligence AlphaFold umí ze sekvence aminokyselin překvapivě dobře určovat trojrozměrnou strukturu proteinů. V tomto případě poskytla informaci o tvaru jednotlivých stavebních kamenů. Kryoelektronová tomografie a další techniky pak doplnily informace o celkovém uspořádání a o integraci póru ve dvojici jaderných membrán.

Ilustrace Agnieszka Obarska-Kosińska, EMBL and MPI of Biophysics, CC BY-NC-SA 4.0

Mosalaganti S. et al.: Science, 2022, DOI: 10.1126/science.abm9506