Férová mykologie

Houby jako symbionti rostlin, umožňující jejich výživu, mají velký ekonomický i ekologický význam jako patogeny i jako zdroj potravy pro řadu komunit. Není divu, že počet prací, které studují složení společenstev hub, exponenciálně roste. Jak se ale v rostoucím množství údajů orientovat? K tomu je potřeba, aby data byla k dispozici, tedy FAIR: findable, accessible, interoperable a reproducible (nalezitelná, dostupná, interoperabilní a reprodukovatelná).

Pracovníci Mikrobiologického ústavu AV ČR v Praze vytvořili za podpory Grantové agentury ČR databázi složení houbových společenstev všech terestrických biomů, obsahující v současnosti přes 20 000 vzorků a více než 650 milionů pozorování jednotlivých druhů hub, určených sekvencí DNA, publikovaných ve více než 200 studiích. Většina vzorků zahrnuje půdní společenstva a společenstva hub asociovaných s rostlinami. Databáze GlobalFungi je veřejně dostupná a umožňuje všem zájemcům hledat výskyt jednotlivých druhů či rodů hub a zobrazit environmentální parametry, které charakterizují místa jejich výskytu, nebo studovat složení celých společenstev v konkrétních lokalitách. Databáze bude doplňována na kooperativním principu, takže autoři nových prací mohou přímo prostřednictvím webového rozhraní doplňovat další studie. Náklady vynaložené na získání bohatého materiálu z jednotlivých prací tak mohou přinášet další hodnotu v budoucnosti a prozradit například potenciální odezvu hub na budoucí vývoj klimatu.

Databáze GlobalFungi: místa, z nichž pocházejí data o společenstvech hub.Mapa: https://globalfungi.com

Větrovský T. et al.: Scientific Data, 2020, DOI: 10.1038/s41597-020-0567-7