i

Aktuální číslo:

2021/5

Téma měsíce:

150 let Vesmíru

Férová mykologie

 |  7. 9. 2020
 |  Vesmír 99, 485, 2020/9

Houby jako symbionti rostlin, umožňující jejich výživu, mají velký ekonomický i ekologický význam jako patogeny i jako zdroj potravy pro řadu komunit. Není divu, že počet prací, které studují složení společenstev hub, exponenciálně roste. Jak se ale v rostoucím množství údajů orientovat? K tomu je potřeba, aby data byla k dispozici, tedy FAIR: findable, accessible, interoperable a reproducible (nalezitelná, dostupná, interoperabilní a reprodukovatelná).

Pracovníci Mikrobiologického ústavu AV ČR v Praze vytvořili za podpory Grantové agentury ČR databázi složení houbových společenstev všech terestrických biomů, obsahující v současnosti přes 20 000 vzorků a více než 650 milionů pozorování jednotlivých druhů hub, určených sekvencí DNA, publikovaných ve více než 200 studiích. Většina vzorků zahrnuje půdní společenstva a společenstva hub asociovaných s rostlinami. Databáze GlobalFungi je veřejně dostupná a umožňuje všem zájemcům hledat výskyt jednotlivých druhů či rodů hub a zobrazit environmentální parametry, které charakterizují místa jejich výskytu, nebo studovat složení celých společenstev v konkrétních lokalitách. Databáze bude doplňována na kooperativním principu, takže autoři nových prací mohou přímo prostřednictvím webového rozhraní doplňovat další studie. Náklady vynaložené na získání bohatého materiálu z jednotlivých prací tak mohou přinášet další hodnotu v budoucnosti a prozradit například potenciální odezvu hub na budoucí vývoj klimatu.

Větrovský T. et al.: Scientific Data, 2020, DOI: 10.1038/s41597-020-0567-7

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Informatika, Mykologie
RUBRIKA: Glosy

O autorovi

Petr Baldrian

Doc. RNDr. Petr Baldrian, Ph.D., (*1972) vystudoval mikrobiologii na Přírodovědecké fakultě UK v Praze. V Mikrobiologickém ústavu AV ČR v Praze vede Laboratoř environmentální mikrobiologie. Zabývá se ekologií a fyziologií půdních hub a bakterií.

Baldrian Petr

Doporučujeme

Jaké to je být fanouškem

Jaké to je být fanouškem

Dan Bárta  |  3. 5. 2021
Jsem ročník 1969. Poprvé jsem uviděl Vesmír na stole v kuchyni u svého spolužáka z gymplu v půlce osmdesátek. Na mou nejapnou otázku, jestli „jede...
Složitá jednoduchost virů

Složitá jednoduchost virů uzamčeno

Ivan Hirsch, Pavel Plevka  |  3. 5. 2021
Místo tradičního redakčního rozhovoru tentokrát nabízíme dialog virologů dvou generací a odlišných specializací, Ivana Hirsche a Pavla Plevky.
Časy Vesmíru

Časy Vesmíru

Tomáš Hermann  |  3. 5. 2021
První číslo Vesmíru vyšlo 3. května 1871, časopis tedy letošním květnovým číslem slaví 150. narozeniny. Při cestě do jeho historie můžeme za...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné