i

Aktuální číslo:

2018/6

Téma měsíce:

Komunikace

„1000“ huseníčků přečteno

 |  6. 11. 2017
 |  Vesmír 96, 610, 2017/11

Huseníček rolní (Arabidopsis thaliana) je nejpoužívanější laboratorní modelová rostlina. Jedním z důvodů její obliby je relativně malý genom, který byl u ekotypu Columbia-0 přečten již v roce 2000 (ve stejném roce jako genom lidský) a je vhodný pro genetické experimenty. Před několika lety vznikla iniciativa „1001 genomes“ (http://1001genomes.org), jejímž cílem bylo kromě jiného osekvenování co nejvyššího počtu ekotypů huseníčku vyskytujícího se v různých částech světa. Jednou z motivací bylo vytvořit co nejširší platformu pro nástroj, který umožňuje studovat vztahy mezi různými genotypy a jejich fenotypovými projevy, tzv. GWAS (Genome Wide Associated Study; http:// www.gwascentral.org). Jen velmi málo biologických systémů v sobě skrývá tak vysoký potenciál pro takové genetické studie jako právě huseníček. V loňském roce iniciativa „1001 genomes“ publikovala práci, v níž uvádí osekvenování 1135 genomů různých ekotypů huseníčku. Někteří vědci neskrývají nadšení z toho, co může GWAS ve spojení se stále větším množstvím dostupných genetických informací o různých ekotypech přinést. Relativně blízká budoucnost ukáže, zda je toto nadšení oprávněné, či nikoliv. Co ale můžeme s jistotou říci, že výsledky tohoto projektu upevňují místo huseníčku mezi elitou organismů, co se genetické prostudovanosti týče.

The 1001 Genomes Consortium, Cell 166, 481, 2016/2, DOI: 10.1016/j.cell.2016.05.063;

T. Kawakatsu et al., Cell 166, 492, 2016/2, DOI: 10.1016/j.cell.2016.06.044.

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Genetika
RUBRIKA: Mozaika

O autorovi

Martin Janda

 

Doporučujeme

Tři sestry postmoderních válek

Tři sestry postmoderních válek

Eva Bobůrková  |  4. 6. 2018
Mohli to být i vaši sousedi, ale teď to jsou váleční zabijáci. Proč jdou tito chlapi do války? Jiní muži jdou zase vydělávat do ciziny a v rodné...
Tajná služba hlásí

Tajná služba hlásí

Tereza Petrusková  |  4. 6. 2018
Nepochybně i teď, kdy čtete tyto řádky, někdo ve vaší blízkosti odposlouchává. Nemusí to být nutně policie, podezřívající vás z organizovaného...
Neznámá tvář molekul života

Neznámá tvář molekul života

Ondřej Vrtiška  |  4. 6. 2018
Vztah nukleových kyselin a proteinů je podle středoškolských učebnic poměrně prostý. DNA nese dědičnou informaci, RNA je její poslíček a proteiny...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné