i

Aktuální číslo:

2018/9

Téma měsíce:

Zde domov můj

„1000“ huseníčků přečteno

 |  6. 11. 2017
 |  Vesmír 96, 610, 2017/11

Huseníček rolní (Arabidopsis thaliana) je nejpoužívanější laboratorní modelová rostlina. Jedním z důvodů její obliby je relativně malý genom, který byl u ekotypu Columbia-0 přečten již v roce 2000 (ve stejném roce jako genom lidský) a je vhodný pro genetické experimenty. Před několika lety vznikla iniciativa „1001 genomes“ (http://1001genomes.org), jejímž cílem bylo kromě jiného osekvenování co nejvyššího počtu ekotypů huseníčku vyskytujícího se v různých částech světa. Jednou z motivací bylo vytvořit co nejširší platformu pro nástroj, který umožňuje studovat vztahy mezi různými genotypy a jejich fenotypovými projevy, tzv. GWAS (Genome Wide Associated Study; http:// www.gwascentral.org). Jen velmi málo biologických systémů v sobě skrývá tak vysoký potenciál pro takové genetické studie jako právě huseníček. V loňském roce iniciativa „1001 genomes“ publikovala práci, v níž uvádí osekvenování 1135 genomů různých ekotypů huseníčku. Někteří vědci neskrývají nadšení z toho, co může GWAS ve spojení se stále větším množstvím dostupných genetických informací o různých ekotypech přinést. Relativně blízká budoucnost ukáže, zda je toto nadšení oprávněné, či nikoliv. Co ale můžeme s jistotou říci, že výsledky tohoto projektu upevňují místo huseníčku mezi elitou organismů, co se genetické prostudovanosti týče.

The 1001 Genomes Consortium, Cell 166, 481, 2016/2, DOI: 10.1016/j.cell.2016.05.063;

T. Kawakatsu et al., Cell 166, 492, 2016/2, DOI: 10.1016/j.cell.2016.06.044.

Ke stažení

OBORY A KLÍČOVÁ SLOVA: Genetika
RUBRIKA: Mozaika

O autorovi

Martin Janda

 

Doporučujeme

Člověk býložravcem

Člověk býložravcem uzamčeno

František Vyskočil  |  3. 9. 2018
Z dvaceti aminokyselin, které naše tělo potřebuje k vytváření životně důležitých bílkovin, si asi osm neumí vyprodukovat samo. Ještě pár vitaminů...
„Archetyp“ pražské kavárny

„Archetyp“ pražské kavárny

Pavel Janoušek  |  3. 9. 2018
Krásnou literaturu lze číst z mnoha důvodů: ze školní povinnosti, pro zábavu i z potřeby vstoupit při četbě do dialogu s někým, kdo mi může...
Století Československa

Století Československa uzamčeno

Jitka Rychtaříková  |  3. 9. 2018
První světová válka za sebou nechala celosvětovou spoušť, v níž vyhasly miliony životů. Ačkoliv přímé vojenské ztráty v Českých zemích (Čechách,...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné