Nanopórová čtečka proteinů

Technologie nanopórového sekvenování, které patří k moderním metodám čtení DNA, posloužila i k přečtení sekvence aminokyselin v molekule proteinu. Linearizovaný proteinový řetězec (na ilustraci fialově) připojený k DNA (žlutě) prochází nanopórem (zeleně), motorem pohybu je helikáza (červeně). Jednotlivé aminokyseliny specificky mění iontové proudy v póru, což umožňuje jejich identifikaci. Jeden a ten samý proteinový řetězec je možno nechat procházet pórem opakovaně, a tím dosáhnout téměř 100% spolehlivosti. Zatím proběhl test na známém proteinu, do budoucna bude nutno zmapovat více různých peptidů a vytvořit srovnávací databázi odpovídajících proudových charakteristik. Už nyní ale metoda bezpečně odhalí proteiny lišící se od sebe jedinou aminokyselinou.

Ilustrace Cees Dekker Lab TU Delft, SciXel

Brinkerhoff H. et al.: Science, 2021, DOI: 10.1126/science.abl4381