Vizualizace aktivity genů v tisících buněk zároveň

Jak analyzovat transkripty tisícovky genů zároveň v tisících lidských buněk? Tým Lucase Pelkmanse z Univerzity v Curychu vyvinul efektivní metodu, která vůbec poprvé něco takového umožňuje.

Jde o plně automatizovanou proceduru, která zahrnuje použití robotů, automatického fluorescenčního mikroskopu a superpočítače. Když jsou sledované geny aktivní, vytvoří specifické transkripty, které jsou vzápětí obarveny roboty. Takto jasně označené transkripty pak nafotí automatický fluorescenční mikroskop, jehož snímky nakonec analyzuje superpočítač. Vědci využili služeb superpočítače Brutus z ETH v Curychu.

Novou metodu vizualizace podle všeho čeká zářná budoucnost v základním výzkumu i v řadě praktických aplikací. (Nature Methods 10, 1127–1133, 2013)