Proteorodopsin nalezen v mořské bakterii SAR11

Loňské listopadové číslo časopisu Nature (438, 82, 2005) přineslo překvapivou zprávu: Mořská bakterie SAR11 obsahuje proteorodopsinové komplexy. Co je na tom tak zajímavého? Bakterie linie SAR11 jsou zřejmě nejběžnějším mořským organizmem. Vyskytují se po celém světě, od rovníkových oblastí po Severní ledový oceán, přičemž v mnohých oblastech tvoří až polovinu veškerých bakterií. O úspěšné kultivaci SAR11 jsme čtenáře informovali již dříve (Vesmír 82, 396, 2003/7). Loni byla dokončena i sekvenace tohoto mikroorganizmu a podrobná analýza získaného genomu odhalila přítomnost proteorodopsinových genů. Proteorodopsin je protein vzdáleně příbuzný rodopsinu, který je všeobecně známý jako hlavní světločivný prvek v oku. Jakou úlohu však může mít u mořské bakterie? Přítomnost proteorodopsinových genů byla v mořském bakterioplanktonu předpovězena již dříve na základě genetických studií (Vesmír 81, 505, 2002/9). Všeobecně se předpokládalo, že proteorodopsinové pumpy mohou přeměňovat světelnou energii na energii metabolickou (ATP). Pokusy prováděné s izolátem SAR11 však žádný stimulující účinek světla nezaznamenaly, a tak zatím zůstává význam proteorodopsinových komplexů v SAR11 zahalen tajemstvím. Věřme, že ne na dlouho. Mořské mikroorganizmy využívající světlo se intenzivně studují i v České republice, kde se touto problematikou zabývá pracoviště Mikrobiologického ústavu v Třeboni.