Aktuální číslo:

2018/2

Téma měsíce:

Bionika

Led v genomu obratlovců

 |  17. 1. 2005
 |  Vesmír 84, 7, 2005/1

Genomika je na koni a řítí se laboratorní vědou jako splašená. Ze všech stran se na nás hrne záplava studií pohrávajících si rozmanitým způsobem s genomy, které již byly sekvencovány. Gill Bejerano z Kalifornské univerzity v Santa Cruz se spolupracovníky nedávno publikovala výsledky porovnávání genomů některých sekvencovaných živočichů. Šlo jí o to, aby odhalila všechny shodné úseky DNA, které jsou delší než 200 nukleotidů.

Autoři studie analyzovali genomy člověka, potkana a myši. K svému údivu v nich nalezli 481 oblastí, které se shodovaly u všech tří zvířat, a dali jim název „ultrakonzervativní elementy DNA“. S trochou nadsázky lze říct, že je v sekvencích DNA „zamrzlá“ až „zledovatělá“ evoluční historie. Všechny tyto úseky DNA byly pak nalezeny i v genomu psa a kuřete, dvě třetiny z nich také v genomu ryby. Naproti tomu v genomu kompletně sekvencovaných bezobratlých živočichů (sumky, octomilky a háďátka) nebyla po tomhle „ledu“ ani stopa. Zdá se tedy, že úseky DNA „zamrzlé v čase“ pocházejí z raných dob intenzivní evoluce obratlovců a mohou souviset s významnými evolučními novinkami této vývojové linie.

V lidském genomu zasahuje sotva čtvrtina „zmrzlých“ oblastí DNA do DNA kódující nějaký protein, a navíc se většinou v kódující oblasti drží na krajíčku. Na druhou stranu jsou tyto ultrakonzervativní oblasti DNA s geny pravděpodobně různým způsobem spjaty, vyskytují se například v regulačních oblastech genů. U části nalezených ultrakonzervativních oblastí lze vysledovat hierarchii a seskupit je do „rodin“. Tyto elementy mají pravděpodobně společný původ v dávných duplikacích částí genomu.

Nalezené ultrakonzervativní oblasti DNA obratlovců jsou nečekaně dlouhé, pravděpodobně vznikly rychlou evolucí a autoři studie zatím netuší, jaký molekulární mechanizmus udržuje jejich stabilní charakter. (Science 304, 1321–1325, 2004)

Ke stažení

RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Stanislav Mihulka

RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D., (*1973) je šéfredaktorem popularizačního webu Osel.cz. Vystudovaný biolog, kterému učarovala popularizace vědy, taje astrofyziky a magie výchovy tří nespoutaných potomků. Ve službách Slezské univerzity v Opavě popularizuje vědu.
Mihulka Stanislav

Doporučujeme

Návrat Široka

Návrat Široka

Pavel Pipek  |  9. 2. 2018
Zpráva, která na mě právě vyskočila na Twitteru, by asi většinu Evropanů nechala chladnou, ale mé srdce buší tak, že mám chuť okamžitě vyskočit z...
Rytíř našich vod

Rytíř našich vod

Marek Janáč  |  5. 2. 2018
Na stěně ve své kanceláři má vystavené krunýře velkých raků. Za jeho pracovní židlí v akváriu rak. V knihovně knihy o racích a v laboratoři ve...
O kvantových počítačích a šifře RSA

O kvantových počítačích a šifře RSA uzamčeno

Jiří Poš  |  5. 2. 2018
značným příslibem pro výpočetní systémy budoucnosti je rozvíjející se obor kvantových počítačů. Představují naději, že eliminují některá vážná...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné