Aktuální číslo:

2017/12

Téma měsíce:

Kontakty

Led v genomu obratlovců

 |  17. 1. 2005
 |  Vesmír 84, 7, 2005/1

Genomika je na koni a řítí se laboratorní vědou jako splašená. Ze všech stran se na nás hrne záplava studií pohrávajících si rozmanitým způsobem s genomy, které již byly sekvencovány. Gill Bejerano z Kalifornské univerzity v Santa Cruz se spolupracovníky nedávno publikovala výsledky porovnávání genomů některých sekvencovaných živočichů. Šlo jí o to, aby odhalila všechny shodné úseky DNA, které jsou delší než 200 nukleotidů.

Autoři studie analyzovali genomy člověka, potkana a myši. K svému údivu v nich nalezli 481 oblastí, které se shodovaly u všech tří zvířat, a dali jim název „ultrakonzervativní elementy DNA“. S trochou nadsázky lze říct, že je v sekvencích DNA „zamrzlá“ až „zledovatělá“ evoluční historie. Všechny tyto úseky DNA byly pak nalezeny i v genomu psa a kuřete, dvě třetiny z nich také v genomu ryby. Naproti tomu v genomu kompletně sekvencovaných bezobratlých živočichů (sumky, octomilky a háďátka) nebyla po tomhle „ledu“ ani stopa. Zdá se tedy, že úseky DNA „zamrzlé v čase“ pocházejí z raných dob intenzivní evoluce obratlovců a mohou souviset s významnými evolučními novinkami této vývojové linie.

V lidském genomu zasahuje sotva čtvrtina „zmrzlých“ oblastí DNA do DNA kódující nějaký protein, a navíc se většinou v kódující oblasti drží na krajíčku. Na druhou stranu jsou tyto ultrakonzervativní oblasti DNA s geny pravděpodobně různým způsobem spjaty, vyskytují se například v regulačních oblastech genů. U části nalezených ultrakonzervativních oblastí lze vysledovat hierarchii a seskupit je do „rodin“. Tyto elementy mají pravděpodobně společný původ v dávných duplikacích částí genomu.

Nalezené ultrakonzervativní oblasti DNA obratlovců jsou nečekaně dlouhé, pravděpodobně vznikly rychlou evolucí a autoři studie zatím netuší, jaký molekulární mechanizmus udržuje jejich stabilní charakter. (Science 304, 1321–1325, 2004)

Ke stažení

RUBRIKA: Aktuality

O autorovi

Stanislav Mihulka

RNDr. Stanislav Mihulka, Ph.D., (*1973) je šéfredaktorem popularizačního webu Osel.cz. Vystudovaný biolog, kterému učarovala popularizace vědy, taje astrofyziky a magie výchovy tří nespoutaných potomků. Ve službách Slezské univerzity v Opavě popularizuje vědu.
Mihulka Stanislav

Doporučujeme

Přemýšlej, než začneš kreslit

Přemýšlej, než začneš kreslit

Ondřej Vrtiška  |  4. 12. 2017
Nástup počítačů, geografických informačních systémů a velkých dat proměnil tvorbu map k nepoznání. Přesto stále platí, že bez znalosti základů...
Tajemná „Boží země“ Punt

Tajemná „Boží země“ Punt uzamčeno

Břetislav Vachala  |  4. 12. 2017
Mnoho vzácného zboží starověkého Egypta pocházelo z tajemného Puntu, kam Egypťané pořádali časté obchodní výpravy. Odkud jejich expedice...
Hmyz jako dokonalý létací stroj

Hmyz jako dokonalý létací stroj

Rudolf Dvořák  |  4. 12. 2017
Hmyz patří k nejdokonalejším a nejstarším letcům naší planety. Jeho letové schopnosti se vyvíjely přes 300 milionů let a předčí dovednosti všech...

Předplatným pomůžete zajistit budoucnost Vesmíru

Tištěná i elektronická
verze časopisu
Digitální archiv
od roku 1994
Speciální nabídka
pro školy a studenty

 

Objednat předplatné